初等教育系（以下简称初教系）秉承百年闽师培养传统，是福建省基础教育师资培养、培训基地。在小学师资培养上体现出专业传统优良、专业思想稳定、专业技能扎实、专业发展后劲足的鲜明特色。其培养模式、专业设置和课程结构具有鲜明的教师教育特色，毕业生能满足基础教育的现实需求和发展要求，做到零适应期上岗和高质量稳健成长。历年的新师招考入围率和面试过关率在全省小学教育专业位列前茅，对口就业率达90%以上。

初教系现有小学教育、数学教育、语文教育等三个专业，小学教育专业下设：全科教育、综合文科教育和综合理科教育三个方向。小学教育专业2015年获批为福建省示范专业，是福建省首批师范男生免费教育试点专业，2016年“以小学教育为核心专业的专业群建设项目”获批福建省重点建设项目；“福建省基础教育书法教学文科研究中心”在初教系落地，正在建设中。

初教系师资队伍实力雄厚。2017年柔性引进福建师范大学数学与计算机学院陈清华教授担任学术系主任、文学院陈泽平教授担任学术导师，指导初教系专业建设和科学研究。现有专任教师20人，副高及以上职称的教师12人（占总数的60%），博士、硕士研究生学历、学位的教师15人（占总数的75%），长期聘任基础教育一线名师担任教学顾问，承担专业课程教学任务。此外，还有阵容强大的客座教授、副教授、兼职教师的支持体系。

初教系教学设施完善。目前建有理化生实验室、专门的书法教室、书法创作室、数学建模实训室、微格教室、儿童阅读教室、舞蹈厅、琴房、语音室等。

初教系建有市县乡三级教育教学实训基地。闽江师专附属实验小学、市属全部七所小学均为我系实践基地，还建有多所区（县）属小学、乡镇小学实践基地，以及庆城社区、凤湖社区等实训基地，能够满足我系学生的教育教学需求。